Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-CQ95604 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-CQ95604 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-CQ95604 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms