Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
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RABGGTAQ92696 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABGGTAQ92696 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
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RABGGTAQ92696 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
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RABGGTAQ92696 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
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RABGGTAQ92696 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
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