Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWG9

KCNE4, Potassium voltage-gated channel subfamily E member 4, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNE4Q8WWG9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNE4Q8WWG9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNE4Q8WWG9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNE4Q8WWG9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNE4Q8WWG9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNE4Q8WWG9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNE4Q8WWG9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNE4Q8WWG9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNE4Q8WWG9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNE4Q8WWG9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNE4Q8WWG9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNE4Q8WWG9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNE4Q8WWG9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNE4Q8WWG9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNE4Q8WWG9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNE4Q8WWG9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNE4Q8WWG9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNE4Q8WWG9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNE4Q8WWG9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNE4Q8WWG9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNE4Q8WWG9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCNE4Q8WWG9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNE4Q8WWG9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms