Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC40.74■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC40.7■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
TRIM41Q8WV44 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
TRIM41Q8WV44 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
TRIM41Q8WV44 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
TRIM41Q8WV44 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
TRIM41Q8WV44 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
TRIM41Q8WV44 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
TRIM41Q8WV44 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
TRIM41Q8WV44 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
TRIM41Q8WV44 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
TRIM41Q8WV44 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
TRIM41Q8WV44 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
TRIM41Q8WV44 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
TRIM41Q8WV44 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
TRIM41Q8WV44 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
TRIM41Q8WV44 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
TRIM41Q8WV44 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
TRIM41Q8WV44 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
TRIM41Q8WV44 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
TRIM41Q8WV44 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
TRIM41Q8WV44 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
TRIM41Q8WV44 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
TRIM41Q8WV44 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC40.58■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
TRIM41Q8WV44 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
TRIM41Q8WV44 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
TRIM41Q8WV44 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC40.56■■■■■ 4.08
TRIM41Q8WV44 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
TRIM41Q8WV44 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
TRIM41Q8WV44 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
TRIM41Q8WV44 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
TRIM41Q8WV44 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
TRIM41Q8WV44 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
TRIM41Q8WV44 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
TRIM41Q8WV44 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
TRIM41Q8WV44 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
TRIM41Q8WV44 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
TRIM41Q8WV44 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
TRIM41Q8WV44 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
TRIM41Q8WV44 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
TRIM41Q8WV44 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
TRIM41Q8WV44 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
TRIM41Q8WV44 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
TRIM41Q8WV44 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
TRIM41Q8WV44 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
TRIM41Q8WV44 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms