Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATL2Q8NHH9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATL2Q8NHH9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms