Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
COL22A1Q8NFW1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
COL22A1Q8NFW1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
COL22A1Q8NFW1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
COL22A1Q8NFW1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
COL22A1Q8NFW1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
COL22A1Q8NFW1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
COL22A1Q8NFW1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
COL22A1Q8NFW1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
COL22A1Q8NFW1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
COL22A1Q8NFW1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
COL22A1Q8NFW1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
COL22A1Q8NFW1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
COL22A1Q8NFW1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
COL22A1Q8NFW1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
COL22A1Q8NFW1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
COL22A1Q8NFW1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
COL22A1Q8NFW1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
COL22A1Q8NFW1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
COL22A1Q8NFW1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
COL22A1Q8NFW1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
COL22A1Q8NFW1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
COL22A1Q8NFW1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
COL22A1Q8NFW1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
COL22A1Q8NFW1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
COL22A1Q8NFW1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
COL22A1Q8NFW1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
COL22A1Q8NFW1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
COL22A1Q8NFW1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
COL22A1Q8NFW1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
COL22A1Q8NFW1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
COL22A1Q8NFW1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
COL22A1Q8NFW1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
COL22A1Q8NFW1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
COL22A1Q8NFW1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
COL22A1Q8NFW1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
COL22A1Q8NFW1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
COL22A1Q8NFW1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
COL22A1Q8NFW1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
COL22A1Q8NFW1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
COL22A1Q8NFW1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
COL22A1Q8NFW1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms