Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DTX3Q8N9I9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DTX3Q8N9I9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DTX3Q8N9I9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DTX3Q8N9I9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DTX3Q8N9I9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DTX3Q8N9I9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
DTX3Q8N9I9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DTX3Q8N9I9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DTX3Q8N9I9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DTX3Q8N9I9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DTX3Q8N9I9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DTX3Q8N9I9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DTX3Q8N9I9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DTX3Q8N9I9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DTX3Q8N9I9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DTX3Q8N9I9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DTX3Q8N9I9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DTX3Q8N9I9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DTX3Q8N9I9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DTX3Q8N9I9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DTX3Q8N9I9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DTX3Q8N9I9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DTX3Q8N9I9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DTX3Q8N9I9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DTX3Q8N9I9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DTX3Q8N9I9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DTX3Q8N9I9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DTX3Q8N9I9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DTX3Q8N9I9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DTX3Q8N9I9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DTX3Q8N9I9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DTX3Q8N9I9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DTX3Q8N9I9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DTX3Q8N9I9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DTX3Q8N9I9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DTX3Q8N9I9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DTX3Q8N9I9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms