Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZCCHC9Q8N567 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZCCHC9Q8N567 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC9Q8N567 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms