Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms