Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTOP2Q7RTS6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTOP2Q7RTS6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
OTOP2Q7RTS6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms