Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Q7L0L9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q7L0L9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q7L0L9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Q7L0L9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q7L0L9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q7L0L9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q7L0L9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q7L0L9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q7L0L9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q7L0L9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Q7L0L9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q7L0L9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q7L0L9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q7L0L9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q7L0L9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Q7L0L9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q7L0L9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q7L0L9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q7L0L9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q7L0L9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q7L0L9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q7L0L9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q7L0L9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q7L0L9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q7L0L9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q7L0L9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q7L0L9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q7L0L9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q7L0L9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q7L0L9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q7L0L9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q7L0L9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q7L0L9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q7L0L9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q7L0L9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Q7L0L9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Q7L0L9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q7L0L9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q7L0L9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q7L0L9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q7L0L9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q7L0L9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Q7L0L9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q7L0L9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q7L0L9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q7L0L9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q7L0L9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q7L0L9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Q7L0L9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q7L0L9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q7L0L9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q7L0L9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Q7L0L9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q7L0L9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q7L0L9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q7L0L9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q7L0L9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q7L0L9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Q7L0L9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q7L0L9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q7L0L9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q7L0L9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q7L0L9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q7L0L9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q7L0L9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q7L0L9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q7L0L9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q7L0L9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q7L0L9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q7L0L9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q7L0L9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q7L0L9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q7L0L9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q7L0L9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q7L0L9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Q7L0L9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Q7L0L9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q7L0L9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q7L0L9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q7L0L9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q7L0L9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q7L0L9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q7L0L9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Q7L0L9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q7L0L9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q7L0L9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q7L0L9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q7L0L9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q7L0L9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q7L0L9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q7L0L9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q7L0L9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q7L0L9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q7L0L9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q7L0L9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q7L0L9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q7L0L9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q7L0L9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q7L0L9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms