Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC80Q76M96 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms