Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
BRINP3Q76B58 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
BRINP3Q76B58 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
BRINP3Q76B58 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
BRINP3Q76B58 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
BRINP3Q76B58 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
BRINP3Q76B58 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
BRINP3Q76B58 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
BRINP3Q76B58 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
BRINP3Q76B58 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
BRINP3Q76B58 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
BRINP3Q76B58 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
BRINP3Q76B58 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
BRINP3Q76B58 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
BRINP3Q76B58 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
BRINP3Q76B58 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
BRINP3Q76B58 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
BRINP3Q76B58 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
BRINP3Q76B58 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
BRINP3Q76B58 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
BRINP3Q76B58 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
BRINP3Q76B58 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
BRINP3Q76B58 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
BRINP3Q76B58 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
BRINP3Q76B58 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms