Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
CD109Q6YHK3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CD109Q6YHK3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CD109Q6YHK3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CD109Q6YHK3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CD109Q6YHK3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CD109Q6YHK3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CD109Q6YHK3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CD109Q6YHK3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CD109Q6YHK3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CD109Q6YHK3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CD109Q6YHK3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CD109Q6YHK3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CD109Q6YHK3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CD109Q6YHK3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CD109Q6YHK3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CD109Q6YHK3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
CD109Q6YHK3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CD109Q6YHK3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CD109Q6YHK3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CD109Q6YHK3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CD109Q6YHK3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CD109Q6YHK3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CD109Q6YHK3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CD109Q6YHK3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CD109Q6YHK3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CD109Q6YHK3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
CD109Q6YHK3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CD109Q6YHK3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CD109Q6YHK3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CD109Q6YHK3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CD109Q6YHK3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CD109Q6YHK3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CD109Q6YHK3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CD109Q6YHK3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CD109Q6YHK3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CD109Q6YHK3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CD109Q6YHK3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CD109Q6YHK3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CD109Q6YHK3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CD109Q6YHK3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CD109Q6YHK3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CD109Q6YHK3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CD109Q6YHK3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CD109Q6YHK3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CD109Q6YHK3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CD109Q6YHK3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
CD109Q6YHK3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CD109Q6YHK3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CD109Q6YHK3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms