Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PACS1Q6VY07 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms