Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VSTM1Q6UX27 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSTM1Q6UX27 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSTM1Q6UX27 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms