Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CASC1Q6TDU7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CASC1Q6TDU7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASC1Q6TDU7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms