Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM88Q6PEY1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms