Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

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Length 78 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CSAG1Q6PB30 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CSAG1Q6PB30 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CSAG1Q6PB30 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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CSAG1Q6PB30 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CSAG1Q6PB30 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
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