Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F5

TRIM40, Tripartite motif-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM40Q6P9F5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM40Q6P9F5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM40Q6P9F5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM40Q6P9F5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM40Q6P9F5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM40Q6P9F5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM40Q6P9F5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms