Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C22orf39Q6P5X5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C22orf39Q6P5X5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C22orf39Q6P5X5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms