Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGMBQ6NW40 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RGMBQ6NW40 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGMBQ6NW40 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RGMBQ6NW40 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGMBQ6NW40 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGMBQ6NW40 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGMBQ6NW40 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGMBQ6NW40 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGMBQ6NW40 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RGMBQ6NW40 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGMBQ6NW40 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGMBQ6NW40 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGMBQ6NW40 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGMBQ6NW40 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RGMBQ6NW40 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms