Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC8EQ6NSJ5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8EQ6NSJ5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8EQ6NSJ5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8EQ6NSJ5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8EQ6NSJ5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8EQ6NSJ5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8EQ6NSJ5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8EQ6NSJ5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8EQ6NSJ5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8EQ6NSJ5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8EQ6NSJ5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8EQ6NSJ5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8EQ6NSJ5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8EQ6NSJ5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC8EQ6NSJ5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms