Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LCN12Q6JVE5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms