Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LHX8Q68G74 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms