Protein–RNA interactions for Protein: Q68DV7

RNF43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF43Q68DV7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF43Q68DV7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms