Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SFMBT2Q5VUG0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SFMBT2Q5VUG0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFMBT2Q5VUG0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms