Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HES3Q5TGS1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168 ms