Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRAPPC3LQ5T215 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAPPC3LQ5T215 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC3LQ5T215 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms