Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZB4

C9orf50, Uncharacterized protein C9orf50, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50Q5SZB4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C9orf50Q5SZB4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf50Q5SZB4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
C9orf50Q5SZB4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C9orf50Q5SZB4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C9orf50Q5SZB4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C9orf50Q5SZB4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C9orf50Q5SZB4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C9orf50Q5SZB4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C9orf50Q5SZB4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C9orf50Q5SZB4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C9orf50Q5SZB4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C9orf50Q5SZB4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C9orf50Q5SZB4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C9orf50Q5SZB4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C9orf50Q5SZB4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C9orf50Q5SZB4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms