Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC153Q494R4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms