Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTLL9Q3SXZ7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms