Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRTAP27-1Q3LI81 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRTAP27-1Q3LI81 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRTAP27-1Q3LI81 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRTAP27-1Q3LI81 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRTAP27-1Q3LI81 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
KRTAP27-1Q3LI81 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
KRTAP27-1Q3LI81 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
KRTAP27-1Q3LI81 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KRTAP27-1Q3LI81 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP27-1Q3LI81 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms