Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPEL1Q2QD12 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPEL1Q2QD12 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms