Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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KCNMB1Q16558 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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KCNMB1Q16558 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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KCNMB1Q16558 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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KCNMB1Q16558 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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KCNMB1Q16558 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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KCNMB1Q16558 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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KCNMB1Q16558 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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KCNMB1Q16558 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
KCNMB1Q16558 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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