Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDCD2Q16342 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD2Q16342 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD2Q16342 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms