Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC1Q15751 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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