Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SF3A2Q15428 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms