Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRIN2CQ14957 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN2CQ14957 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms