Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.647e-8■■■□□ 17.8
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PUM1Q14671 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.527e-8■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 PRMT1-214ENST00000529836 580 ntTSL 317.58■□□□□ 0.47e-8■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.44e-6■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 FAM13A-203ENST00000502459 1993 ntTSL 216.63■□□□□ 0.257e-8■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.194e-6■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 MINK1-208ENST00000572629 827 ntTSL 316.25■□□□□ 0.197e-8■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.154e-6■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 LRCH4-202ENST00000467201 4754 ntTSL 215.01□□□□□ -0.017e-8■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.174e-6■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 FAM13A-210ENST00000507352 1306 ntTSL 1 (best)11.82□□□□□ -0.527e-8■■■□□ 17.8
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PUM1Q14671 CBFB-206ENST00000565389 846 ntTSL 1 (best)9.7□□□□□ -0.867e-8■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 EHBP1-217ENST00000472809 1374 ntTSL 59.47□□□□□ -0.897e-8■■■□□ 17.8
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PUM1Q14671 EHBP1-205ENST00000413434 533 ntTSL 49.2□□□□□ -0.947e-8■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 MYO6-203ENST00000369981 8692 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.965e-7■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 FAM13A-207ENST00000504836 2287 ntTSL 29.03□□□□□ -0.967e-8■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 MYO6-204ENST00000369985 8575 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.995e-7■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 EHBP1-211ENST00000449820 539 ntTSL 58.85□□□□□ -0.997e-8■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 EHBP1-207ENST00000426940 586 ntTSL 48.77□□□□□ -1.017e-8■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 PRMT1-208ENST00000527412 463 ntTSL 38.7□□□□□ -1.027e-8■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 MYO6-207ENST00000615563 4026 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.15e-7■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.165e-7■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.175e-7■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.245e-7■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 EHBP1-219ENST00000494958 1127 ntTSL 1 (best)6.21□□□□□ -1.427e-8■■■□□ 17.8
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PUM1Q14671 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.617e-8■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 COMT-210ENST00000467943 546 ntTSL 224.63■■□□□ 1.539e-8■■■□□ 17.8
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PUM1Q14671 PPP4R3A-202ENST00000554390 2953 ntTSL 1 (best)16.02■□□□□ 0.157e-7■■■□□ 17.8
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PUM1Q14671 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -07e-7■■■□□ 17.8
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PUM1Q14671 ODF2-216ENST00000483070 723 ntTSL 510.68□□□□□ -0.71e-7■■■□□ 17.8
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PUM1Q14671 S100A13-201ENST00000339556 514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.921e-7■■■□□ 17.8
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PUM1Q14671 TSPYL2-204ENST00000556808 4178 ntTSL 28.77□□□□□ -1.015e-6■■■□□ 17.8
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PUM1Q14671 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.183e-6■■■□□ 17.7
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PUM1Q14671 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.087e-7■■■□□ 17.7
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PUM1Q14671 GNAS-222ENST00000464624 3764 ntTSL 513.16□□□□□ -0.34e-9■■■□□ 17.7
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PUM1Q14671 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.514e-9■■■□□ 17.7
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PUM1Q14671 GNAS-204ENST00000313949 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.894e-9■■■□□ 17.7
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PUM1Q14671 ACTB-212ENST00000484841 1032 ntTSL 521.57■■□□□ 1.045e-11■■■□□ 17.7
PUM1Q14671 ACTB-210ENST00000477812 820 ntTSL 219.27■□□□□ 0.685e-11■■■□□ 17.7
PUM1Q14671 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.285e-11■■■□□ 17.7
PUM1Q14671 ACTB-207ENST00000462494 2245 ntTSL 516.13■□□□□ 0.175e-11■■■□□ 17.7
PUM1Q14671 ACTB-204ENST00000425660 1845 ntTSL 1 (best)14.22□□□□□ -0.135e-11■■■□□ 17.7
PUM1Q14671 ACTB-209ENST00000473257 556 ntTSL 312.23□□□□□ -0.455e-11■■■□□ 17.7
PUM1Q14671 TPM3-216ENST00000473036 746 ntTSL 213.83□□□□□ -0.22e-11■■■□□ 17.7
PUM1Q14671 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.135e-7■■■□□ 17.6
PUM1Q14671 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.585e-7■■■□□ 17.6
PUM1Q14671 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.36e-7■■■□□ 17.6
PUM1Q14671 MORC3-205ENST00000487909 4131 ntTSL 25.07□□□□□ -1.66e-7■■■□□ 17.6
PUM1Q14671 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.012e-6■■■□□ 17.6
PUM1Q14671 TOMM7-204ENST00000463284 731 ntTSL 213.75□□□□□ -0.212e-6■■■□□ 17.6
PUM1Q14671 TOMM7-202ENST00000372879 514 ntTSL 4 BASIC8.08□□□□□ -1.122e-6■■■□□ 17.6
PUM1Q14671 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.392e-6■■■□□ 17.6
PUM1Q14671 TOMM7-205ENST00000483581 551 ntTSL 1 (best)4.14□□□□□ -1.752e-6■■■□□ 17.6
PUM1Q14671 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.712e-6■■■□□ 17.6
PUM1Q14671 SPPL2B-213ENST00000621568 1017 ntTSL 518.08■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 17.6
PUM1Q14671 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.112e-6■■■□□ 17.6
PUM1Q14671 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.312e-6■■■□□ 17.6
PUM1Q14671 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.45e-7■■■□□ 17.6
PUM1Q14671 RBM25-205ENST00000527432 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.012e-7■■■□□ 17.6
PUM1Q14671 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.222e-7■■■□□ 17.6
PUM1Q14671 RBM25-212ENST00000532683 6848 ntTSL 1 (best)5.73□□□□□ -1.492e-7■■■□□ 17.6
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