Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM25Q14258 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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