Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CDK13Q14004 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
CDK13Q14004 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CDK13Q14004 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CDK13Q14004 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CDK13Q14004 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CDK13Q14004 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CDK13Q14004 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CDK13Q14004 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CDK13Q14004 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
CDK13Q14004 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CDK13Q14004 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CDK13Q14004 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CDK13Q14004 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CDK13Q14004 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CDK13Q14004 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CDK13Q14004 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CDK13Q14004 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CDK13Q14004 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
CDK13Q14004 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CDK13Q14004 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CDK13Q14004 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
CDK13Q14004 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CDK13Q14004 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CDK13Q14004 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CDK13Q14004 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CDK13Q14004 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
CDK13Q14004 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CDK13Q14004 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC37■■■■□ 3.51
CDK13Q14004 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CDK13Q14004 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CDK13Q14004 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CDK13Q14004 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CDK13Q14004 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CDK13Q14004 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
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