Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIPK1Q13546 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms