Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1H3Q13133 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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