Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C2orf54Q08AI8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms