Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CXCL9Q07325 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CXCL9Q07325 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms