Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ATP7AQ04656 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ATP7AQ04656 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
ATP7AQ04656 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ATP7AQ04656 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ATP7AQ04656 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
ATP7AQ04656 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ATP7AQ04656 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ATP7AQ04656 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ATP7AQ04656 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ATP7AQ04656 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ATP7AQ04656 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ATP7AQ04656 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ATP7AQ04656 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
ATP7AQ04656 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ATP7AQ04656 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ATP7AQ04656 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ATP7AQ04656 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ATP7AQ04656 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ATP7AQ04656 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ATP7AQ04656 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ATP7AQ04656 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ATP7AQ04656 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ATP7AQ04656 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
ATP7AQ04656 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ATP7AQ04656 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ATP7AQ04656 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ATP7AQ04656 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ATP7AQ04656 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ATP7AQ04656 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ATP7AQ04656 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ATP7AQ04656 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ATP7AQ04656 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ATP7AQ04656 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ATP7AQ04656 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ATP7AQ04656 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ATP7AQ04656 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ATP7AQ04656 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
ATP7AQ04656 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ATP7AQ04656 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ATP7AQ04656 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ATP7AQ04656 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ATP7AQ04656 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ATP7AQ04656 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms