Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEFA6Q01524 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms