Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MDM2Q00987 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms