Protein–RNA interactions for Protein: P62341

SELENOT, Thioredoxin reductase-like selenoprotein T, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOTP62341 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOTP62341 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOTP62341 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOTP62341 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOTP62341 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOTP62341 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOTP62341 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOTP62341 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOTP62341 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOTP62341 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOTP62341 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOTP62341 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SELENOTP62341 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SELENOTP62341 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms